Uzun kullanım süresi sonrasında baş ağrısı ve mide bulantısına sebep olduğu bilinen 3D efektine sahip olan 3DS'in bu konuda büyük bir sıkıntıya sebep olmayacağını açıklayan Nintendo Amerika başkanı Reggie Fils-Ailme;
"Nintendo 3DS sağlık sorunlarına sebep olacak bir özelliğe sahip değil. Uzmanlarla birlikte sahada uzun süre testler gerçekleştirdik. Her zaman için piyasaya en iyi ve en kaliteli ürünü sunmak için uğraşıyoruz. " dedi.
Bu açıklamalardan sonra ise Reggie, tüm 3D efekt sahibi oyun ve film gibi görsellerde olduğu gibi resmi yapılması gereken uyarıyı dile getirerek, 3D efektlerinin göz kasları tam gelişimini tamamlamamış olan 7 yaş altı çocuklar için uygun olmadığını belirtti.
Varolan protokole göre tüm 3D görsellerde bu uyarının yapılması mecburidir. Nintendo'nun 90'lı yıllarda çıkan "Virtual Boy" isimli 3D efektlere sahip konsoluda aynı uyarıyı içeriyordu.