Nintendo'nun yeni el konsolu 3DS ile birlikte kapak tasarımlarında da DS'e göre ufak bir farka gidilmişti. Konsol logo yeri ve bazı ufak farklar dışında DS tasarımına benzer bir kutu tasarımı tercih eden Nintendo, özel oyunlarında ise bu kutu tasarımlarında daha farklı uygulamalara gideceğe benziyor.
Konsolun en çok beklenen oyunlarından biri olan The Legend of Zelda: Ocarina of Time 3DS'in kapak tasarımında da ufak bir farklılığa gidilmiş. Kapak tasarımının iç kısmında serinin sembollerinden biri haline gelen Rupi (Rupees) şekillerine yer verilmiş.